Tato část vede shodně s trasou 1.koridoru, který je z větší části již dokončen.

Trať vede mírně zvlněnou krajinou, mezi stanicemi Praha-Vršovice a Benešov u Prahy je dvoukolejná, zbytek tratě je jednokolejný. Traťové rychlosti se zde pohybují od 70 po 100 km/h. První stavbou na 4.tranzitním železničním koridoru je úsek Praha-Hostivař - Strančice, jehož optimalizace byla zahájena v září 2005. Další stavbou bude optimalizace trati Strančice - Benešov u Prahy, která by měla být zahájena letos na podzim.

Trať je až na pár krátkých úseků jednokolejná. Trať vede mírně zvlněnou krajinou. Traťové rychlosti se zde pohybují od 70 po 100 km/h. První stavbou, která bude na této části koridoru zahájena bude modernizace trati Tábor - Doubí u Tábora.

Tato první stavba v rámci modernizace 4.tranzitního koridoru byla zahájena v září 2005. Její součástí bude rekonstrukce tří železničních stanic a tří mezistaničních úseků. Mezi zastávkou Světice a stanicí Strančice bude trať přeložena do nové polohy.

Optimalizace dalšího úseku 4.tranzitního koridoru byla zahájena přípravnými pracemi v říjnu 2006. Výlukové práce budou probíhat v mezistaničním úseku odbočka Bedrč - Benešov a v železničních stanicích Senohraby a Benešov.

Přípravné práce na modernizaci první části úseku Tábor - Veselí nad Lužnicí byly zahájeny v prosinci 2006. Tento úsek zahrnuje modernizaci stanic Tábor a Planá nad Lužnicí. Celá trať bude zdvoukolejněna a vedena převážně ve stopě stávající trati.